O bairro, por não possuir saneamento básico, enfrenta problemas de esgoto.
Os moradores do Botujuru, passam por sérias dificuldades. Por ser uma região considerada como zona rural, o SEMAE não leva o saneamento básico para a população.
A pedido da moradora Roberta Siqueira, a vereadora Inês Paz (PSOL) compareceu ao bairro no ultimo dia 3 de setembro, para averiguar a situação e constatou que muitas casas se encontram com fossas contaminadas por produtos químicos, em decorrência das plantações de cogumelos. É necessário um tratamento intenso na água da região.

Fossa contaminada.
Outro exemplo que demonstra a falta de abastecimento é que muitos moradores do bairro precisam se abastecer pelo caminhão pipa que traz água para igrejas e creches.
A vereadora se comprometeu a enviar pedidos ao Semae para que a situação do bairro possa melhorar.